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陇孔沟小型金矿床属于北祁连金成矿带南亚带（托莱山-达板山亚带）。构造位置处于加里东褶皱带托莱山北坡复向斜，赋矿岩系为下奥陶统阴沟群的中基性火山-沉积岩系，金的活化、迁移主要发生在岩体和围岩接触带、断裂构造破碎蚀变带内（韧性剪切带）。根据相关资料分析金矿物质主要来自超基性岩体，矿体的成矿流体来源于深部。金矿的形成与早古生代板块构造演化过程及一直持续到中新生代的漫长而复杂的多旋回造山作用过程密切相关。成因与构造破碎蚀变带有密切关系的变质-热液型小型金矿床。