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分子标记辅助选择逐步成为植物育种的重要方法。然而需要更多的实用的分子标记，尤其是与重要农艺性状紧密连锁的标记。目前，许许多多的方法已经应用到棉花结构基因组的标记开发，但是棉花SNP标记鲜见报道。FIF1基因是棉纤维优势表达的一个基因，研究证明它在棉纤维的发育过程中起着很重要的调控作用。根据已发表的亚洲棉FIF1基因，设计特异引物，克隆了陆地棉TM-1和海岛棉海7124中FIF1基因。根据2个四倍体棉花FIF1基因的SNP变异，采用SNAP和CAPs方法将该基因定位到四倍体棉花遗传图谱上。研究表明棉花SNP