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黄元御精研易理，援易入医，以易理阐发医理，用医理弘扬易理，并有《周易悬象》一书，其对“医易同源”阐述极深。黄氏把人体视做宇宙的缩影。以象、数、理为纽带将人与自然同构，形成宇宙全息论。他妙解河图之数，巧释生男生女之理，其对脏腑生理功能的阐述则更为精详，并将其运用临床，用治伤寒、温病和杂病等。其对五运六气的解释也具独到之处，可谓一代医易大家。