【摘 要】
:
新一代测序平台的诞生推动了对全基因组鸟枪法测序数据的拼接算法和软件的研究,自2005年以来多种用于高通量测序的序列拼接软件已经被开发出来,并且在不断地进行改进以提高拼
【机 构】
:
军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室,北京市计算中心生物学研究室
【基金项目】
:
国家高技术研究发展计划项目(2009AA02Z111), 国家科技重大专项基金(2008ZX10001-013)
论文部分内容阅读
新一代测序平台的诞生推动了对全基因组鸟枪法测序数据的拼接算法和软件的研究,自2005年以来多种用于高通量测序的序列拼接软件已经被开发出来,并且在不断地进行改进以提高拼接效果。本文利用目前广泛使用的高通量测序拼接软件Velvet、AbySS、SOAPdenovo和CLC Genomic Workbench分别对本试验室分离的一株噬菌体IME08的高通量测序结果进行拼接,介绍这几种拼接软件的安装使用及参数优化,并对不同软件的拼接结果进行比较,针对不同的拼接软件得到优化的拼接参数,可为其他研究人员使用上述软件提
其他文献
目的通过对特定人群胆碱能性荨麻疹流行病学调查及资料分析,探讨影响胆碱能性荨麻疹发病的各因素的作用和意义,并根据中医“四诊”原则,对阳性患者进行中医辨证分型研究,为胆
急性冠状动脉综合征( ACS)是指由完全或不完全闭塞性血栓形成所致的急性心肌缺血综合征。抗栓治疗是ACS患者实现再灌注治疗的基石。近年来,随着我国农村地区居民急性心肌梗死
研究了自适应时延估计方法的性能,提出了收敛因子的自动调节改进算法,改进了收敛速度和误差调整系数之间的矛盾,并进行了计算机模拟以验证方法的有效性。
已有研究证明,HIV整合位点的选择,与宿主基因组功能和染色体结构特性之间存在着紧密的联系,但是具体的选择机制还不明确。使用聚类分析、特征提取、分类分析等生物信息学方法
研究了两种Al-27Zn合金经425℃×8h固溶及125℃时效处理后组织结构、硬度和耐磨性的变化规律.结果表明,经时效处理后合金的组织形态为:Al基体上均匀分布着少量未溶树枝状晶
基于密度泛函理论(DFT)研究腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤、胞嘧啶以及腺嘌呤胸腺嘧啶碱基对、鸟嘌呤胞嘧啶碱基对。在DFT—B3LYP/6—31G-水平上利用自然键轨道理论分析研究结果显示
首次采用添加分散剂溶胶-凝胶法制备软磁纳米材料Fe2O3,采取添加分散剂和改变焙烧方法保证晶粒尺寸.实验结果表明:软磁纳米晶制备中添加分散剂尿素,然后在高温(600℃)焙烧前
本文在引入近似度等概念的基础上,构造了频繁近似模式,并证明了相关性质,同时提出了相应的频繁近似模式的挖掘算法(SFAP)算法。实验结果表明该算法能有效挖掘DNA序列中的频繁近似
在瓦赫特尔的指引下,我们退回到两百年前的那棵梧桐树下。这是1792年,24个银行家、经纪人.野心家或者梦想者在这里签订了《梧桐树协议》.由此开启了这个金融帝国的大门。