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清代西藏地方政府设置"阿里总管"（噶尔本）一职,作为阿里地区的最高军政长官。其历史可追溯到1680年前后西藏地方政府派出蒙藏联军收复古格旧地之际。早期的阿里总管带有强烈的军事管制性质。18世纪上半期,准噶尔问题突出,在清朝中央的关注与决策下,阿里总管的军事力量得到强化,其权力与地位在西藏政治中举足轻重,成为各方争夺的焦点。珠尔默特那木扎勒之乱后,新组建的噶厦政府为阿里地区最高军政事务的处理确立了双长官领导体制。而1760年代以后,随着准噶尔的平定与清朝中央注意力转移,阿里总管的实权和地位逐渐下降,至清末已不复当年了。