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微卫星DNA，又称短串联重复序列（STR）或简单序列重复（SSR），是广泛存在于真核生物基因组中的简单重复DNA片段，一般每个重复单位仅1～6个碱基，重复数为10～20次，其中动物体中以双核苷酸（CA／GT）n最为常见。根据微卫星DNA核心序列两端的保守序列设计引物扩增基因组DNA便可以找到相应的微卫星标记。微卫星标记已广泛应用于人类和动植物遗传育种、遗传图谱绘制、数量性状位点定位、标记辅助选择、遗传多样性评估等方面的研究。