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目的：调查独龙江水生丝孢菌资源,了解其多样性特征。方法：从独龙江中段（海拔1285-1692m）采集沉水腐木90份,采用保湿培养法对水生丝孢菌进行培养,基于形态学特征对水生丝孢菌进行鉴定。结果：通过形态学特征比较,共鉴定出水生丝孢菌38属49种。结论：独龙江水生丝孢菌资源丰富,多样性指数为3.56,其中Sporidesmiella（20%）、Ellisembia（8.9%）、Helminthosporium（6.7%）、Minimelanolocus（5.6%）的出现频率相对较高。