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ISSR-抑制-PCR法是小随体的一种简单分离方法，不需要构建基因组文库。实验方法：①用6种限制性酶消化基因组DNA；②把连接物添加到限制片断上；③把小随体基序的10个重复序列和连接物序列作为引物进行PCR；④对产物进行克隆和排序；⑤根据附加序列和排序查明小随体单侧的序列，再利用其单侧序列进行嵌套式PCR；⑥用产物的克隆和排序这种简单而基础性技术进行试验。