【摘 要】
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利用Signal P 4.0、Lipo P 1.0及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定
【基金项目】
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烟草病虫害检测与综合治理重点开放实验室开放课题经费(项目号:bc2011);中国烟草总公司科技重点项目(项目号110201202002)
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利用Signal P 4.0、Lipo P 1.0及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs(Open reading frame)所编码的N端有信号肽序列,占全部ORFs的8.81%。其中351条分泌型信号肽(SPI),81条脂蛋白型信号肽(SPII)。在分泌型信号肽中,信号肽的长度为11~42个氨基酸,以长度为22个氨基酸的信号肽最多。同源性分析
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