基于群体分化指数FST的绵羊全基因组选择信号检测

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xaolan811

【摘要】

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本研究基于苏尼特羊（n=66）、德国肉用美利奴羊（n=159）和杜泊羊（n=93）3个群体的Illumina OvineSNP50芯片分型数据，借助群体分化指数F_ST法进行群体间选择信号的检测分析，应用生物信息

【作者】

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曾滔赵福平王光凯吴明明魏彩虹张莉李利张红平杜

【机构】

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四川农业大学动物科技学院,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,中国农业大学动物科技学院

【出处】

：

畜牧兽医学报

【发表日期】

：

2013年12期

【关键词】

：

绵羊基因组选择信号候选基因群体分化指数(F_ST ) sheep genome selection signatures candidate gene

【基金项目】

：

现代农业产业技术体系建设专项肉羊体系岗位科学家（CARS-39-04B）,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目（2012cj-2）

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本研究基于苏尼特羊（n=66）、德国肉用美利奴羊（n=159）和杜泊羊（n=93）3个群体的Illumina OvineSNP50芯片分型数据，借助群体分化指数F_ST法进行群体间选择信号的检测分析，应用生物信息学方法分析寻找选择信号区域内的重要基因。结果，共找到343个“离群”位点，通过基因注释找到这些位点对应的365个候选基因。其中部分基因与绵羊生长、繁殖及肉质性状相关，如IGF2PB3、IGFlR、BMP2、BMPRlB、CAPN3等，本研究结果也进一步验证了前期利用CNV和GWAS研究检测到的基因

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