我国不同地区分离的七株庚型肝炎病毒5'非编码区部分核酸序列比较

来源 :中华预防医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cool_1944
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目的探索中国株庚型肝炎病毒(HGV)基因的变异。方法采用HGV中国株5’非编码区序列设计引物、逆转录套式聚合酶链反应法,检测中国不同地区血清中的HGVRNA,7份阳性产物采用ABIPrism377DNA自动测序仪进行序列测定。结果测定的2l3个碱基中,7株中国HGV分离株与非洲株GBVC(u36380)序列同源性分别为88.26%、85.92%、88.26%、85.45%、86.85%、8592%和88.26%,与美国株HGV(u44402)序列同源性分别为92.02%、86.85%、86.67%、89.20%、8967%、89.67%和9l.55%,而中国HGV分离株间的同源性均高于92.02%。结论中国HGV分离株基因型不同于美国报道的GBVC和HGV亚型 Objective To explore the variation of HGV gene in China. Methods The primers of HGV 5 ’untranslated region (HGV) in China were designed and reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to detect HGV RNA in serum of different regions of China. Seven positive products were sequenced by ABIPrism 377 DNA sequencer. The results showed that the sequence homologies of 7 Chinese HGV isolates with that of the African strain GBV-C (u36380) were 88.26%, 85.92%, 88.26% and 85.45%, respectively, in 2l3 bases. 86.85%, 8592% and 88.26%, respectively. The homologies with the American strain HGV (u44402) were 92.02%, 86.85%, 86.67%, 89.20%, 89 67%, 89.67% and 9l. 55%, while the homology between Chinese HGV isolates was higher than 92.02%. Conclusion The genotypes of Chinese HGV isolates are different from the GBVC and HGV subtypes reported by the United States
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