【摘 要】
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本研究旨在探索延边牛种质资源的遗传多样性、群体遗传结构，并挖掘延边牛适应性相关基因。基于75个牛的全基因组数据（延边牛16个，安格斯牛4个、西门塔尔牛8个、海福特牛2个、韩牛8个、中国瘤牛7个、哈萨克牛9个、蒙古牛7个、印度瘤牛6个，均来自于NCBI公共数据库），对延边牛血统组成、基因组变异及首选择基因进行分析。结果表明，延边牛具有东亚普通牛和欧洲普通牛血统，其中东亚普通牛血统占比78%，欧洲普通
【基金项目】
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国家肉牛牦牛产业技术体系（CARS-37）；
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本研究旨在探索延边牛种质资源的遗传多样性、群体遗传结构，并挖掘延边牛适应性相关基因。基于75个牛的全基因组数据（延边牛16个，安格斯牛4个、西门塔尔牛8个、海福特牛2个、韩牛8个、中国瘤牛7个、哈萨克牛9个、蒙古牛7个、印度瘤牛6个，均来自于NCBI公共数据库），对延边牛血统组成、基因组变异及首选择基因进行分析。结果表明，延边牛具有东亚普通牛和欧洲普通牛血统，其中东亚普通牛血统占比78%，欧洲普通牛血统占比22%。纯合片段（ROH）统计显示，在所有品种中发现的绝大多数ROH长度在0.5-1Mb之间。欧洲商业品种（安格斯牛、海福特牛和西门塔尔牛）具有更多的中等（2-4Mb）及长ROH片段（＞4 Mb），表明欧洲商业品种近期受到的人工选择程度极高。延边牛具有最多的0.5-1 Mb短ROH片段，说明延边牛的选育程度比欧洲商业肉牛品种低。基于基因组杂合度揭示的近交系数表明，在所有群体中，安格斯牛的近交系数最高（0.54），中国瘤牛最低（- 0.71）。平均基因组核苷酸多样度结果显示，中国瘤牛＞印度瘤牛＞蒙古牛＞ 哈萨克牛＞西藏牛＞延边牛＞韩牛＞西门塔尔牛＞安格斯牛＞海福特牛。选择信号扫描分析发现四个与延边牛脂肪调控相关的基因（ADRB3，PDE3B，SORLA，TMEM135 ），可能与其寒冷气候适应性相关。
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