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采用微波细胞破胞法处理深黄被孢霉，并对破胞后的菌体进行甲醇萃取油脂过程的研究。通过测量细胞内蛋白质释放量，确定微波处理的较佳条件为微波强度420W，反应2min。对微波后菌体进行扫描电镜观察，菌丝出现孔洞和裂纹，结构完全被破坏，达到微波破胞的效果；再直接进行甲酯化反应，通过正交试验考察固液比、反应温度、KOH浓度以及反应时间对甲酯化得率的影响。结果表明微生物油脂甲酯化的最佳条件：固液比（g/mL）1：5，温度50℃，KOH甲醇质量分数2．5％，时间2h，此备件下干菌含油率为51．3％。