采用CTAB法提取2种花色白芨基因组DNA,选用trnH-psbA、rbcL、ITS、LSU D1-D3 4种植物DNA条形码通用引物进行PCR扩增,分析黄花、紫花白芨(Bletilla striata)4种DNA条形码的序列,扩增产物纯化后连接T载体并测序,用DNAMAN软件对测序结果进行多序列比对分析。再根据SNP位点设计引物,利用位点特异性PCR扩增进行鉴定。结果表明,4对植物DNA条形码通用引物均能进行扩增,其中trnH-psbA序列没有发现SNP位点、rbcL序列出现2个SNP位点、ITS序列出现62个SNP位点、LSU D1-D3序列出现3个SNP位点。根据LSU D1-D3序列上的2个SNP位点设计的引物DUAN5(5′-TAGTAACGGCGAGCGAAC-3′)和JDHH(5′-TTATCAGCTTCCTTGCGCCCG-3′)能准确鉴定出黄花白芨,成功获得鉴定黄花白芨的引物序列。