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目的
通过生物信息学的方法分析无/轻度肺气肿与严重肺气肿患者的差异基因。
方法从基因表达数据库（GEO）下载无/轻度肺气肿与严重肺气肿患者的肺组织芯片数据GSE1650，通过t检验获得差异基因。然后使用DAVID数据库对差异表达基因进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。再利用STRING数据库对差异表达基因进行蛋白相互作用网络（PPI）分析，并选出关键基因。
结果共获得76个差异基因，其中在严重肺气肿组中表达上调的基因有62个，表达下调的基因有14个。GO富集分析表明差异基因主要参与了中性粒细胞趋化、细胞对白细胞介素-1的反应、细胞外基质（ECM）组织、免疫反应。KEGG信号通路富集分析主要包括了细胞因子-细胞因子受体相互作用、ECM受体相互作用、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B（PI3K-AKT）信号通路、血小板激活。PPI分析筛选获得了17个关键基因，分别为CXCL8、RRAD、CLU、TIMP1、SEPP1、ISLR、BGN、COL1A1、COLIA2、ACTA2、ACTN1、FIGF、TPM1、TPM2、LUM、COL6A3、TAGLN。其中有15个上调基因（CLU、TIMP1、SEPP1、ISLR、BGN、COLIA2、COL1A1、ACTA2、ACTN1、FIGF、TPM1、TPM2、LUM、COL6A3、TAGLN），2个下调基因（CXCL8、RRAD）。
结论基于GEO数据库的生物信息学分析，严重肺气肿与无/轻度肺气肿患者存在差异基因。