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文章借鉴德国环境经济账户中的生态效率指标,构建了测度三峡库区农业生态效率的指标体系。采用超效率DEA模型测算出三峡库区25个区县的农业生态效率值,结果表明:库首地区除夷陵区外,整体在库区中较为落后;库中地区除巫溪县外,明显整体生态效率较差;而库尾地区除渝北区以外排名整体靠前,农业生态效率较高。综合技术效率、纯技术效率和规模效率是限制农业生态效率提升的瓶颈因素。城市化率增加、城乡差异缩小与农业经济相对增速持续提高能促使三峡库区农业生态效率的提高。