【摘 要】
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目的利用生物信息数据库结合生物实验分析RCN3(Reticulocalbin3)在结肠癌中的表达及其临床意义。方法选取结肠癌HT29和SW620细胞以及结肠正常黏膜细胞FHC进行培养，采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和蛋白免疫印迹(Westernblot)实验验证RCN3在细胞中的表达情况。利用Ualcan数据库获取RCN3在正常结肠组织和结肠癌组织中的表达数据。从LinkedOmics数据库获取RCN3的共表达基因信息，通过基因本体论分析(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路
【机 构】
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川北医学院附属医院胃肠外科，南充 637000川北医学院肝胆胰肠研究所，南充 637000川北医学院肝胆胰肠研究所，南充 637000川北医学院肝胆胰肠研究所，南充 637000川北医学院肝胆胰肠研究
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目的利用生物信息数据库结合生物实验分析RCN3(Reticulocalbin 3)在结肠癌中的表达及其临床意义。
方法选取结肠癌HT29和SW620细胞以及结肠正常黏膜细胞FHC进行培养，采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)实验验证RCN3在细胞中的表达情况。利用Ualcan数据库获取RCN3在正常结肠组织和结肠癌组织中的表达数据。从LinkedOmics数据库获取RCN3的共表达基因信息，通过基因本体论分析(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析确定这些RCN3共表达基因参与的生物学过程及相关功能。利用STRING数据库构建RCN3相关编码基因的蛋白互作网络。最后，根据GEPIA、Ualcan和LinkedOmics生物数据库共同对比分析RCN3的表达与结肠癌患者临床预后的关系。
结果qRT-PCR和Western-blot实验结果显示HT29和SW620结肠癌细胞中RCN3的mRNA和蛋白表达水平均高于FHC正常细胞(均P
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