基于网络药理学与生物信息学揭示冬凌草调控乳腺癌能量代谢的作用及分子机制

来源 :中国现代应用药学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yoursbin
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 基于网络药理学结合生物信息学、分子对接探究冬凌草调控乳腺癌能量代谢的作用及分子机制。方法 通过多个数据库结合文献查找冬凌草的有效成分,筛选已报道的冬凌草中具有抗肿瘤作用并符合类药五原则的活性成分;利用PubChem数据库、PharmMapper数据库收集冬凌草抗肿瘤活性成分的结构及其潜在靶点。从TCGA和GEO数据库获取乳腺癌样本转录组数据,通过差异表达基因分析及WGCNA挖掘乳腺癌相关靶点,并与冬凌草抗肿瘤活性成分预测靶点匹配映射,获得两者的共同靶点,之后进行GO和KEGG富集分析。使用STRING数据库对共同靶点构建PPI网络,通过Cytoscape软件对网络进行可视化,使用DEGREE和MCC两种算法分别取PPI网络中排名前10的靶点,两者去重后与富集排名靠前的能量代谢相关通路和生物学过程中的靶点取交集,得到能量代谢相关的关键靶点。随后,通过UALCAN数据库分析能量代谢相关的关键靶点的表达量,利用TIMER数据库分析这些靶点与免疫浸润的关系。最后,将这些靶点与有预测关系的活性成分进行分子对接。结果 选取冬凌草中冬凌草甲素、冬凌草乙素、鲁山冬凌草丙素、β-蒎烯、D-柠檬烯、太白乌霉素A及信阳冬凌草素J共7个活性成分及其潜在靶点368个,与乳腺癌相关靶点映射得到共同靶点34个。GO和KEGG富集分析发现大部分排名靠前的功能/通路与糖、脂代谢相关,从这些功能/通路得到PCK1、ADH1C、AKR1C3、HSD11B1、MAOA、ALDH2、RBP4这7个能量代谢相关的关键靶点,这些靶点在乳腺癌中的m RNA、蛋白水平的表达量均低于正常组织,且均与肿瘤纯度呈负相关;此外,CD4+T细胞、CD8+T细胞等免疫细胞的浸润程度也会影响乳腺癌患者的预后。分子对接结果表明上述7个有效成分与其有预测关系的靶点有良好结合潜力。结论 冬凌草抗乳腺癌具有多成分、多靶点、多信号通路协同作用的特征,其可能通过调控乳腺癌的能量代谢实现清热解毒之功,从而发挥抗乳腺癌作用。
其他文献
"汉"作为文化符号,最早是指汉水。西汉王朝建立后,才出现了"汉家"的称谓。前四史皆有"汉家"的称谓,是家国一体文化背景之下,汉朝国家政权在民众国家认同中的反映,也是汉朝文化共同体形成的重要标志,同时也是民族自豪感与自信心的反映。
随着商业地产开发模式的不断创新和电子商务的迅猛发展,大型零售商之间的竞争变得越来越激烈,采用的促销策略越来越复杂化,促销费用也越来越高,因此采取合适的促销策略成为零售商的制胜法宝。联合促销凭借其特有的优势被越来越多的零售商所青睐,但大多零售商对于联合促销并没有全面的认识。基于此,本文采用文献研究法和定性分析法对大型零售商在进行联合促销时所运用的纵向型联合促销策略和横向型联合促销策略进行全面研究。
生态环境标准制度是环境法律体系的重要组成部分,生态环境标准的法律性质是生态环境标准制度得以有效实施的前提,但学界对此仍未形成共识。本文通过对现有观点的梳理和讨论,回顾生态环境标准为何需要进入环境法律体系,并着重从生态环境标准的规范效力的角度反思生态环境标准的法律性质,提出生态环境标准应定位为独立于法律法规和规章的、本身不具有法律性质和法律效力的技术规范。
随着素质教育的全面推进,民族教育事业也有了长足发展。藏族作为我国分布较广、人数较多的民族之一,无论是教育水平的进步,还是民众科学文化素质的提升都备受关注。在近年来民族大团结、藏汉文化不断融合的背景下,藏区逐渐发展出以藏语为基础,通过学习汉语来提升教学质量、增进民族交流的双语教学模式。本文围绕高中藏语文教育现状,对新时期的藏汉双语教学的实践途径和具体方法展开探索。
在晋冀豫边界地区,一些互不相邻的村庄之间建立起了亲如兄弟、情同手足、和而不同、差异共生的情谊共同体,这种共同体关系谓之“社亲”。根据功能和意涵的不同,社亲可分为武社亲、文社亲和新社亲三种。在社亲文化传承过程中,晋冀豫边界地区的散杂居民族共同建构了一种跨民族跨区域的和谐族际生态体系。在田野调查的基础上,探究社亲之间的多维互动,寻绎位育在散杂居民族族际生态建构中的实践逻辑,审视社亲这一概念蕴含的族群互
为促进“水稻-草莓”模式的推广应用,缓解因茬口紧张而导致迟栽草莓前期产量低的瓶颈问题,设计了一种利用垄型土槽耦合基质栽培草莓的方法。设置了6个不同草莓推迟移栽时间(即推迟0、5、10、15、20、25 d)处理,分别用R0、R5、R10、R15、R20、R25表示,以常规栽培为对照,用CK表示;测定了不同处理初果期、盛果期、末果期的草莓产量,草莓茎基宽、株高等农艺性状,探讨了推迟移栽时间对草莓生产
<正>鳞状细胞癌简称鳞癌,又称棘细胞癌。是一种发生于上皮细胞的肿瘤。来源于表皮角质形成细胞。临床表现:皮损初起常为小而硬的红色结节,境界不清;易演变成疣状或乳头瘤状,呈菜花状;表面可有鳞屑,中央易发生溃疡;部分肿瘤可进一步侵犯其下方的筋膜、肌肉和骨骼;可发生淋巴结转移。
会议
使用基于全卷积神经网络的U-net模型提取遥感影像中的建筑物,采用公开的Massachusetts建筑物数据集进行模型的训练,并通过迁移学习的思想对网络的权重进行微调,以便快速高效地训练模型,从而输出更高的精度。实验结果显示,U-net模型在准确度、召回率和F1值三项精度指标中分别达到0.958 52、0.881 09和0.821 23,与传统方法进行对比,建筑物的轮廓更加完整,准确度提高25%以