科研院所的创新能力直接关系到一个区域的自主创新能力，关系到创新型国家和创新型省份宏伟目标的实现。在全国事业单位改革的进程中，科研院所面临着战略和功能的重新定位以及体制机制的变革，如何在这一进程中迎接挑战，抓住机遇，提高科研院所的创新能力，在区域创新体系中发挥出创新源头和支撑服务的作用，是值得我们深入研究的重要问题。
　　
　　一、科研院所创新能力的内涵和定位
　　
　　1、科研院所创新能力的内涵
　　目前，从国内外的研究看，对科研院所的创新能力研究得并不多。创新能力的概念可以从国家、产业、企业的角度分别理解。国家创新能力是指一个国家运用各种资源依靠国家创新体系进行创新活动的能力。产业技术创新能力是指通过开发或引进新技术，推动产业发展的能力。企业创新能力代表性的观点有：技术创新能力是组织能力、适应能力、创新能力和技术与信息的获得能力的综合(Larry Westphal，1981)；创新能力是产品开发能力、改进生产技术的能力、储备能力、组织能力的综合(Seven Muller)，等等。科研院所的创新能力需要纳入到区域经济体系中进行研究。对于公益类科研院所和产业、行业(集群)技术中心，是为区域的科技发展和行业整体创新提供科技支撑和科技服务的，应包括知识创新、技术创新和技术扩散以及与这些活动相关的政策安排。转制后的科研院所成为科技型企业，按照企业的规范去运作，其创新能力主要指的是技术创新能力。我们认为，科研机构创新能力的共性核心要素包括创新资源投入能力、创新管理能力、创新倾向、研究开发能力和创新产出能力这五个要素，公益类科研机构和行业类技术中心还应包括技术扩散能力，转制类科技机构则应包括生产开发(制造)能力和市场开发(营销)能力。
　　
　　2、政府支持建立科研院所的原因及经验
　　科技创新研究需要投入大笔的资金，且往往在数年之后才能显现其经济效益，不是一般企业所能负担的，同时公益性的创新和外部效应大的创新，单个企业也不愿意做。为此，由政府资助的研发机构以及高校所组成的科技基础结构在技术援助方面扮演了重要角色。政府资助研发机构进行共同产业研究，并将研究成果转移给企业应用，这主要是在市场机制失灵的领域。
　　
　　二、全国和山东地方属科研院所创新能力比较
　　
　　1、科技人力
　　自1999年科研机构开始进行企业化转制和分类改革以后，全国和山东的研究与开发机构科技人员均呈下降趋势，全国研究与开发机构的科学家与工程师人数从1996年的38.5万人减少到2004年的26.3万人，山东省研发机构的科技活动人员则从1999年的1.99万人下降到2005年的1.62万人，占全国的比重也略有下降。从研发机构人数占全部科技活动人数的比重看，山东和全国一样，比重均下降到1999年的一半，而山东的这一比重又仅仅是全国平均水平的一半。
　　
　　2、科技经费
　　2005年，全国研发机构科技活动经费筹集额为950.4亿元，其中政府资金为76.4亿元。山东研发机构科技活动经费筹集额为19.5亿元，其中政府资金为13.9亿元。2005年，研发机构的人均科技活动经费比1999年有较大增长，全国从9.8l万元/人提高到20.85万元/人，山东则从7.55万元/人提高到12.01万元/人。可以看出，山东省研发机构的人均科技活动经费虽有较大增长，但投入强度仍仅相当于全国平均水平的57.6％。从研发经费内部支出来看，2005年，山东研发机构R