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南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室的主体,源自成立于20世纪50年代的林木遗传育种研究室,1993年吸收相关科学力量,正式组建为林木遗传和基因工程实验室,1995年被正式命名为林木遗传和基因工程国家林业局重点实验室.2000年学校转制后,实行国家林业局和江苏省共同管理的模式,江苏省人民政府又将实验室列入江苏省重点建设的实验室.实验室由施季森教授为主任,学术委员会主任为中国工程院院士、我国著名的林木遗传学教授王明庥教授.