【摘 要】
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目的:使用生物信息学的方法,分析肺癌细胞(A549)经慢病毒感染后,过表达超保守区基因与正常肺癌细胞之间的差异基因,并进行基因功能和信号通路分析,为肺癌研究提供差异基因。方法
【机 构】
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河北医科大学第三医院呼吸内科,石家庄市第一医院呼吸内科
【基金项目】
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河北省卫计委青年科技课题(2015043463);河北省卫计委青年科技课题(20160602)
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目的:使用生物信息学的方法,分析肺癌细胞(A549)经慢病毒感染后,过表达超保守区基因与正常肺癌细胞之间的差异基因,并进行基因功能和信号通路分析,为肺癌研究提供差异基因。方法:在公共数据库(GEO)中下载6个肺癌细胞差异基因表达阵列数据进行生物信息学分析,筛选出相关的差异基因。使用DAVID和STRING数据库对差异基因表达进行基因功能、信号通路和蛋白互作用分析。结果:共得到230个差异基因,其中217个表达上调,13个表达下调;GO富集分析显示差异基因主要定位于细胞膜外,参与血管内皮生长因子的调节;KE
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