由于磷肥的过量施用，使磷在土壤中富集，存在对环境造成污染的潜在风险。通过对比1980、2010和2020年焉耆盆地耕层有效磷的含量变化，分析土壤有效磷的时空富集特征，利用相对生态风险系数对研究区进行环境风险分析。结果表明：1980～2020年间焉耆盆地耕地有效磷处于增加态势，由中低水平升高到丰富水平，有效磷含量提高了2.66倍，年均增加0.62 mg/kg，博湖县年均增加量最高，为0.96 mg/kg。通过空间插值分析，1980年焉耆盆地耕层土壤有效磷含量以中等为主，2010年耕层土壤有效磷含量以较丰富为主，2020年耕层土壤有效磷含量以丰富为主，博湖县、和静县、焉耆回族自治县耕层土壤有效磷呈现富集。根据2020年耕层土壤有效磷相对生态风险系数，借助ArcGIS空间插值分析，得到研究区耕地土壤有效磷环境生态风险区。焉耆盆地部分耕地土壤有效磷有潜在的生态风险，合计面积为1811.45 km~2，占研究区耕地面积的64.34%，以中、低生态风险为主；高风险面积很小，仅占研究区耕地面积的0.01%。各县耕地有效磷存在潜在风险的面积由大到小为：和静县＞焉耆回族自治县＞博湖县＞和硕县。因此，针对焉耆盆地耕层有效磷富集特征，为减少面源污染风险，应对不同土壤磷环境风险采取区域养分管理策略，减磷增效，以促进环境保护。