【摘 要】
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GATA转录因子在植物中广泛存在,并参与生长发育、生物和非生物胁迫等多种生物学过程,为深入阐明GATA基因家族在剑麻相关生物学过程中的重要功能.本研究基于转录组水平鉴定手
【机 构】
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中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,湛江市热出作物遗传改良重点大实验室,湛江,524091
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GATA转录因子在植物中广泛存在,并参与生长发育、生物和非生物胁迫等多种生物学过程,为深入阐明GATA基因家族在剑麻相关生物学过程中的重要功能.本研究基于转录组水平鉴定手段,对剑麻基因家族进行鉴定分析以及表达模式研究.在前期己完成的RNA-seq数据上,利用相关软件对剑麻GATA基因家族进行鉴定,同时对得到的剑麻GATA基因进行理化性质、保守结构域、进化关系和表达模式分析.在剑麻中共筛选获得23个GATA基因,其编码蛋白质的氨基酸数目在118~581之间,分子量约为12.74~64.87 ku,等电点为5.19~10.22.亚细胞定位预测结果显示18个AhGA TAs定位于细胞核,3个AhGATAs定位于叶绿体,2个定位于线粒体.AhGATAs基因家族含有GATA、RPN13_C、AhXH、CCT和Tify这5个相对保守的结构域.进化树分析表明剑麻GATA蛋白可分为5个亚家族.23个剑麻GATA基因在剑麻紫色卷叶病不同发病时期呈现不同的表达规律.本研究在转录水平上初步完成了剑麻GATA基因家族的鉴定与功能分析,为后续深入解析AhGATAs基因在剑麻中的具体功能提供参考.
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