【摘 要】
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AP2/ERF转录因子家族是植物特有的最大转录因子家族,其家族成员参与植物发育及病原菌防御调控.前期转录组研究发现南瓜AP2/ERF转录因子家族成员在南瓜雌花正常及败育材料中差异表达.本研究对1个显著差异AP2/ERF转录因子基因进行了同源克隆、生物信息学分析以及亚细胞定位.研究结果显示,该基因CDS全长1029 bp,编码342个氨基酸;蛋白序列包含1个AP2和1个B3结构域,属于AP2/ERF转录因子RAV亚家族,命名为CmRAV基因,该蛋白二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋构成;该蛋白无跨膜结构和信
【机 构】
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河南科技学院园艺园林学院,河南新乡453003;河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心,河南新乡453003
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AP2/ERF转录因子家族是植物特有的最大转录因子家族,其家族成员参与植物发育及病原菌防御调控.前期转录组研究发现南瓜AP2/ERF转录因子家族成员在南瓜雌花正常及败育材料中差异表达.本研究对1个显著差异AP2/ERF转录因子基因进行了同源克隆、生物信息学分析以及亚细胞定位.研究结果显示,该基因CDS全长1029 bp,编码342个氨基酸;蛋白序列包含1个AP2和1个B3结构域,属于AP2/ERF转录因子RAV亚家族,命名为CmRAV基因,该蛋白二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋构成;该蛋白无跨膜结构和信号肽;CmRAV蛋白质等电点为9.04,分子量为38.32 kDa,为亲水性不稳定蛋白.多序列比对和系统进化树分析结果显示,CmRAV蛋白序列与美洲南瓜、印度南瓜、甜瓜和黄瓜的RAV氨基酸序列一致性较高,中国南瓜与美洲南瓜亲缘关系最近.通过水稻原生质体亚细胞定位分析,发现该蛋白位于细胞核.表达分析结果显示,该基因在花不同结构及叶片中都具有较高的表达.
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