【摘 要】
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matK基因广泛应用于植物亲缘关系和物种鉴定研究.利用生物信息学对赛黑桦matK基因进行开放阅读框、氨基酸组成、蛋白质跨膜结构区、亚细胞定位和结合区分析,预测信号肽、氨基
【机 构】
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北华大学林学院,中国铁路沈阳局集团有限公司长春林业总场,集安市林业局
【基金项目】
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吉林省教育厅科学技术研究项目(JJKH20180348KJ);北华大学青年培育基金项目(2017QNJJL07)
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matK基因广泛应用于植物亲缘关系和物种鉴定研究.利用生物信息学对赛黑桦matK基因进行开放阅读框、氨基酸组成、蛋白质跨膜结构区、亚细胞定位和结合区分析,预测信号肽、氨基酸亲/疏水性、氨基酸二级结构,利用同源建模构建赛黑桦成熟酶K的三维结构及12种桦木属植物的系统进化树.结果表明:赛黑桦matK基因序列长度为2 524 bp,有13个开放阅读框;matK基因编码的成熟酶K含20种氨基酸,由17.86%的α螺旋、9.52%的β折叠和72.62%的无规则卷曲组成,为亲水性蛋白,具有10个蛋白结合区和1个多核苷
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