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目的基因和标记基因是高考考试大纲明确要求的考试内容，在基因工程专题和高考中处于重要的地位．在构建的基因表达载体中，二者的作用有显著差别，目的基因承载了人类转基因的目标，通过目的基因完成对生物性状的定向改造；标记基因的作用是筛选成功导入目的基因的细胞，是一种筛选工具．本文将从功能的角度，区别目的基因与标记基因的本质属性，为该内容的教学提供参考．