【摘 要】
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目的 基于系统药理学和分子对接解析湖南省预防新冠肺炎2号方(简称湘NCP2方)防治新冠肺炎的作用机制.方法 基于SCIFINDER、TCM@Taiwan、TCMSP等药理学网络数据库检索湘NCP2方的化学成分和作用靶点;在Genecards和OMIM中检索SARS-CoV-2感染人体相关靶点,String 11.0等数据库收集靶点之间的蛋白质相互作用信息,Cytoscape3.7.2构建化合物-靶点网络,DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;选取核心有效成分,Autodock Vina软件
【机 构】
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湖南中医药大学,湖南长沙410208;深圳市罗湖区人民医院,广东深圳518001;深圳大学第三附属医院,广东深圳518001;深圳市罗湖区人民医院,广东深圳518001;深圳大学第三附属医院,广东深圳
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目的 基于系统药理学和分子对接解析湖南省预防新冠肺炎2号方(简称湘NCP2方)防治新冠肺炎的作用机制.方法 基于SCIFINDER、TCM@Taiwan、TCMSP等药理学网络数据库检索湘NCP2方的化学成分和作用靶点;在Genecards和OMIM中检索SARS-CoV-2感染人体相关靶点,String 11.0等数据库收集靶点之间的蛋白质相互作用信息,Cytoscape3.7.2构建化合物-靶点网络,DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;选取核心有效成分,Autodock Vina软件将其与SARS-CoV-2 3CL水解酶和ACE2进行分子对接.结果 有效成分-作用靶点网络包含267个作用靶点和121种有效成分,共同调控的靶点为CASP3、FOS、CREB1、CCL2、IL10、BCL2L1、IFNG、CXCL10、DPP4.生物过程的富集主要涉及炎症、免疫等,细胞组分富集主要与外泌体等有关,分子功能主要与酶结合、药物反应和病毒受体活性有关.KEGG通路富集筛选得到6条信号通路(P＜0.05),涉及TNF信号通路、T细胞受体信号传导途径、Toll样受体信号通路、B细胞受体信号传导途径、NF-KB信号通路等.核心有效成分与SARS-CoV-2 3CL水解酶和ACE2展现了良好的对接活性.结论 湘NCP2方可通过炎症、免疫等生物过程和信号通路,以及作用SARS-CoV-2 3CL水解酶、ACE2等SARS-CoV-2相关蛋白来防治新冠肺炎.
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