【摘 要】
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本研究分别对新老窖泥样本的16S rDNA V4和V3-V4区进行Illumina高通量测序,比较了测序的群落多样性参数、NMDS聚类与优势门/属的相对丰度。V4区的OTUs数目（264～639）显著低于V3-V4区（459～1123）;V4区的Shannon指数在新、老池壁泥中（2.47、5.02）显著低于V3-V4区（3.33、6.46）,而在新（4.98 vs 5.98）、老（5.64 vs
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本研究分别对新老窖泥样本的16S rDNA V4和V3-V4区进行Illumina高通量测序,比较了测序的群落多样性参数、NMDS聚类与优势门/属的相对丰度。V4区的OTUs数目（264～639）显著低于V3-V4区（459～1123）;V4区的Shannon指数在新、老池壁泥中（2.47、5.02）显著低于V3-V4区（3.33、6.46）,而在新（4.98 vs 5.98）、老（5.64 vs 5.39）池底泥样本中无显著差异（p>0.05）;V4区的Chao1指数在新池底泥（2455 vs 1358）、新池壁泥（1326 vs 504）和老池底泥（3475 vs 1260）中显著高于V3～V4区,在老池壁泥中无显著差异（1915 vs 1312）（p>0.05）。两个可变区的测序对NMDS聚类规律无影响。热图聚类结果显示,两个可变区的优势门/属的相对丰度很接近,V4区在属水平上更容易区分老窖池的池底泥。与V3-V4区相比,V4区更利于区分池壁泥与池底泥,且可以检测出甲烷菌的含量,更有利于窖泥菌群组成分析。本研究为16S rDNA高通量测序中V3-V4区与V4区的选择提供一定参考。
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