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采用随机扩增多态性DNA技术（RAPD）对我国6省区玉米丝黑穗病菌的生理分化情况进行了初步研究。通过10个随机引物将来自于吉林、辽宁、黑龙江、山西、河北、内蒙古自治区的102株玉米丝黑穗病菌大致划分为6个类群（卡目似系数0．42），在更高的相似水平上，类群A和类群B还可以进一步划分为众多的亚群。从聚类分析的结果可以看出，相似性较高的菌株大多来源于相同或相近的地区，说明玉米丝黑穗病菌的亲缘关系存在一定的地域性。