生物信息学分析构建自噬基因相关的肝癌预后评估模型

来源 :浙江医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：chenshuae9o

【摘要】

：

目的采用生物信息学分析自噬相关基因差异表达和肝癌预后的关系,构建自噬基因相关的肝癌预后评估模型。方法采用R语言Limma软件包分析癌症基因组图谱(TCGA)肝癌数据库中肝癌组织及癌旁组织中自噬相关基因的表达,发现差异表达基因(DEGs)。采用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析DEGs。采用单因素分析和多因素Cox回归分析构建自噬基因相关的肝癌预后评估模型。结果对比肝癌组织与癌旁组织,发现了60个自噬相关的DEGs;DEGs主要在自噬、HPV感染、凋亡和p53信号通路中富集。单

【作者】

：

刘新会刘斐烨

【机构】

：

南方医科大学中西医结合医院肿瘤科、南方医科大学中西医结合肿瘤中心

【出处】

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浙江医学

【发表日期】

：

2021年12期

【关键词】

：

自噬肝癌预后自噬基因

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(81802733),广东省自然科学基金项目(2018A030313730、2018A030310473),广东省科技创新战略专项资金项目(2018A030310473),南方医科大学中西医结合医院院长基金项目(1201902004)。

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