为探究在三峡水库特殊分层异重流背景下降雨对水华消退的影响，以香溪河为例，对库湾降雨前后水动力、生态环境因子开展连续三维立体跟踪监测。结果表明：降雨对水华的消退作用显著，降雨后香溪河库湾叶绿素a（Chl-a）浓度明显下降。热分层稳定指数（RWCS/H）变化不大，库湾近河口处分层较弱、中上游分层较强的特性并未随此次降雨发生较大变动。受降雨影响，藻类在表层水体聚集程度降低，藻类聚集度指数（MI）、微藻群体平均深度（MRD）下降。库湾流态随降雨发生而变得复杂，库湾水体浊度明显增加，异重流倒灌形式由近表层倒灌向中下层倒灌转变，雨后又逐渐转变为中层倒灌，长江干流水体倒灌进入库湾的影响范围、潜入深度增加。水体水平输移增强，分散下沉的藻类易随水体环流流出库湾，水华消退。雨后库湾入库流量增加，大部分上游来流依旧由上层流向河口，与中层倒灌异重流形成逆时针环流，藻类无法在表层水体稳定生长，库湾Chl-a浓度能在较长时间内保持较低水平，不会再次迅速暴发水华。