论文部分内容阅读
目的:非综合征型唇腭裂（non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P）是一类常见的出生缺陷,现有研究发现的致病基因仅能解释很少一部分遗传度。因此需要探索其他可能的致病机制。本文拟在Hedgehog（HH）通路基因中（PTCH1、PTCH2、SHH、SMO）探索基因多态性对NSCL/P的关联关系以及亲源效应（parent-of-origineffects,PoO）对NSCL/P发病风险的影响。方法:本研究纳入806个中国非综合征型唇腭裂核心家系,对HH通路基因（PTCH1、PTCH2、SHH、SMO）的83个单核苷酸多态性位点（single nucleotide polymorphisms,SNPs）进行传递不平衡检验（transmissiondisequilibriumtest,TDT）,并采用对数线性模型进行亲源效应分析。家系样本来自“唇腭裂危险基因和交互作用的国际合作研究”项目。本研究采用Plink进行TDT检验;通过R软件中的Haplin v6.2.1软件包开展亲源效应分析。采用Bonferroni法进行多重检验校正。结果:经过质量控制,共纳入65个SNPs进行分析,Bonferroni显著性水平为7.7×10-4（0.05/65）。未校正P值前,关联分析发现rs4448343与NSCL/P存在关联（P=0.023）,6个单体型（rs10512249-rs4448343,rs1461208-rs7786445,rs10512249-rs4448343, rs16909865-rs10512249-rs4448343,rs1461208-rs7786445-rs12698335,rs288756-rs288758-rs1151790）与NSCL/P存在关联（P<0.05）;6个单体型（rs288765-rs1233563,rs12537550-rs11765352,rs872723-rs288765-rs1233563, rs288765-rs1233563-rs288756,rs6459952-rs12537550-rs11765352,rs12537550-rs11765352-rs6971211）具有潜在的PoO效应（P<0.05）。以上结果经过多重检验校正,均无统计学意义(P>7.7×10-4)。结论:未发现该通路基因多态性与NSCL/P的关联,未发现该通路基因通过PoO效应影响NSCL/P发病风险。