【摘 要】
：
目的 预测分析牛miR-504(bta-miR-504)靶基因对奶牛乳房炎的调控机制.方法 应用miRBASE数据库检索并分析miR-504成熟序列在不同物种中的保守性,TargetScan及miRWalk软件预测b
【机 构】
：
宁夏大学农学院动物科学系,宁夏银川750021
论文部分内容阅读
目的 预测分析牛miR-504(bta-miR-504)靶基因对奶牛乳房炎的调控机制.方法 应用miRBASE数据库检索并分析miR-504成熟序列在不同物种中的保守性,TargetScan及miRWalk软件预测bta-miR-504的靶基因,DAVID在线软件对靶基因进行GO分类统计注释分析和KEGG通路注释分析,STRING在线软件和Cytoscape软件进行蛋白相互作用分析,采用Cytohubba软件中的11种方法计算并分析候选靶基因中的核心基因.结果 miR-504成熟区序列在不同物种间呈高度保守.共筛选出477个bta-miR-504候选靶基因,其参与的主要生物过程包括细胞内信号转导、细胞内蛋白转运和负调控MAPK活性等,显著富集于癌症、内吞、Ras、雌激素和胰岛素信号通路.与候选靶基因编码蛋白存在较多互作关系的蛋白包括TOLLIP、RIK3Rl、TRAF6、EGFR、FBXL20、FBXL18、FBX041、FBXL12等,其编码基因参与癌症、催乳激素、雌性激素、胰岛素、NF-kappa B、AMPK、Ras、TNF及心肌细胞肾上腺激素等信号通路.bta-miR-504 候选靶基因调控网络中的核心基因为 TRAF6 和 CFTR.结论 bta-miR-504核心候选靶基因TRAF6和CFTR可能通过AMPK、Ras、Hepatitis C和Measles信号通路参与奶牛乳房炎的调控作用.
其他文献
目的探讨铁皮石斛和百令胶囊对自然衰老SD大鼠肠道菌群组成和多样性的影响。方法选取自然衰老SD雄性大鼠30只随机分为5组,分别为铁皮石斛高(400 mg/kg)、中(200 mg/kg)、低(100 mg/kg)剂量组及百令胶囊组(40 mg/kg)、空白对照组,每组6只,对各组大鼠连续灌胃8周。在灌胃结束后,取各组大鼠的新鲜粪便,通过16S rRNA测序技术分析粪便菌群,采用生物信息学方法对大鼠肠道菌群结构和多样性进行分析。结果与空白对照组相比,PCoA和韦恩图分析结果显示铁皮石斛和百令胶囊使大鼠肠道菌群
目的 用马来酰亚胺活化的相对分子质量40 000的聚乙二醇(MAL-PEG40K)定点修饰胰高血糖素样肽-1衍生物(glucagon like peptide-lanalogue,GLP-1a),并分析修饰产物部分性质.方
目的评价Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗(sabin inactivated poliovirus vaccines,sIPV)与3种玻璃包材的相容性。方法将3批sIPV半成品分别分装至同批中性硼硅玻璃管制西林瓶(2 mL)、预灌封注射器及中性硼硅玻璃管制西林瓶(4 mL),将1批sIPV半成品分别分装至3批上述不同的包材中。分别于(37±2)℃保存14 d、(25±2)℃保存6个月、28℃保存36个月,对疫苗的外观、装量、pH、无菌试验、细菌内毒素、D抗原含量等指标进行检测。计算3种包材sIPV于不同温度
目的 制备柯萨奇病毒A2(Coxsackievirus A2,CV-A2)病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs),并对其进行纯化及鉴定.方法 将CV-A2 P1和3CD)基因序列根据昆虫细胞偏好特性进行密
在水力压裂施工中,如何有效获取压裂过程中产生的裂缝形态以及裂缝的动态扩展过程一直是困扰学术界和工业界的问题。目前,常规利用微地震事件定位结果进行分析的方法存在需要人工干预、散点信息表示能力不足等问题;采用数值模拟分析的方法往往因复杂的地下介质情况而引入计算偏差。本文基于非监督学习算法,通过提取微地震事件的空间和时间信息,实现对裂缝平面的识别以及裂缝网络拓展路径的分析;并通过引入水力压裂岩石物理实验,利用实际监测获得的声发射数据以及对应的真实破裂情况的CT扫描数据,检验方法的可行性。最终结果表明,本文所提方
目的探讨肠道病毒71型(EV71)感染手足口病(HFMD)患儿淋巴细胞亚群及炎症因子水平与病情严重程度的相关性,分析其对该病的诊断价值。方法选取2018年1月至2020年1月嘉兴市第一医院收治的100例手足口病患儿为研究对象,根据《手足口病诊疗指南(2018版)》中的标准将患儿分为重症组(40例)和普通组(60例),采用流式细胞术检测淋巴细胞亚群水平,采用ELISA法检测IL-6、IL-8和IL-10水平,对比两组患儿各指标水平。结果重症组患儿外周血T淋巴细胞(CD3+细胞、CD3<
目的分析肿瘤免疫调控新靶点YTH N6-甲基腺苷(m6A)RNA结合蛋白1[YTH N6-methyladenosine(m6A)RNA binding protein 1,YTHDF1]的分子结构及生物学功能。方法应用NCBI、ExPASy、SignalP、PSORTⅡ、SOPMA、STRING、SWISS-MODEL等软件工具分析YTHDF1蛋白的理化性质及其生物学功能,并通过MEGA 7软件建立YTHDF1蛋白的系统进化树。结果YTHDF1是一种不稳定的碱性亲水蛋白质,无信号肽,无跨膜区;YTHDF
目的 比较不同海拔对2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)迁移及黏附功能的影响.方法 选取咸阳市某
2021年5月22日02时04分11.3秒(北京时间)青海果洛州玛多县发生M7.4地震。中国地震台网中心在震后立即启动余震监测和统计工作,于震后9min发布正式速报结果。同时,中国地震台网中心联合多家单位,共产出9类14种数据产品。产品结果显示,本次地震发生在巴颜喀拉块体,位于甘德南缘断裂带和玛多甘德地震带之间,推测极震区的烈度达到Ⅸ度;震源机制解显示该地震为一次走滑型事件,余震在震中两侧均有分布
台风可以改变海面波浪状态并激发出微地动信号,该信号可以传播至陆地并被宽频带地震仪记录到。本研究以201601号台风"尼伯特"为例,利用短时傅里叶变换,分析了7月3日12时至7月9日0时台风期间中国台湾和日本114个宽频带地震仪垂向分量信号功率谱特征。分析结果发现,在7月5日至7月7日之间,当台风距离台站1500～2000km时,中国台湾、琉球群岛及屋久岛的33个地震台站的地振动信号功率谱密度值显著