在调查分析我国科技服务企业发展现状的基础上,以248家在新三板挂牌的科技服务企业2015-2017年面板数据为样本,运用三阶段DEA模型和Malmquist指数,从细分行业、归属地区、所属分层、转让方式等多维视角比较融资效率,基于F分数模型分析企业财务风险,并对56家已从新三板退市的科技服务企业及2 336家在区域股权交易中心挂牌的科技服务企业进行研究。结果表明:制约科技服务企业融资有效性的主要因素不再是规模效率,而是纯技术效率;多维视阈下科技服务企业融资效率和财务风险存在诸多差异。进一步研究发现:融资效率与财务风险存在联动关系,但并非所有新三板企业退市都与融资效率或财务状况有关。鉴于此,为深化新三板市场改革、促进科技服务企业可持续成长,提出严控财务风险、深化服务融合、探索创新分层等建议。