【摘 要】
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为了研究牡丹、芍药远缘杂交胚败育的分子机理,本研究使用BGISEQ-500平台对牡丹、芍药杂交种胚转录组进行测序,通过测序,共得到了92.02 Gb数据.通过拼接组装去冗余后得到了86
【机 构】
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河南农业大学林学院,郑州,450002;河南科技学院园艺园林学院,新乡,453003
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为了研究牡丹、芍药远缘杂交胚败育的分子机理,本研究使用BGISEQ-500平台对牡丹、芍药杂交种胚转录组进行测序,通过测序,共得到了92.02 Gb数据.通过拼接组装去冗余后得到了86 195个Unigene,平均长度为1 189bp.86 195个Unigene在七大功能数据库中进行注释,最终分别有49 172 (NR:57.05％)、38 352(NT:44.49％)、36 477 (SwissProt:42.32％)、38 905 (KOG:45.14％)、37 993 (KEGG:44.08％)、26 832 (GO:31.13％)以及37 758 (Pfam:43.81％)个Unigene获得功能注释.同时还检测出21 998个SSR分布于17 567个Unigene中,其中二核苷酸和三核苷酸这两种重复类型分别有5 628个和2 906个.在17 567个Unigene中预测出1 671个编码转录因子.不同发育时期的胚转录组数据中共筛选出13 974个差异表达基因,其中上调基因有8 647个,下调基因有5 327个.该转录组测序分析为寻找牡丹、芍药远缘杂交胚败育相关基因提供了一定的理论参考.
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