【摘 要】
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为了解广西壮族自治区鸭坦布苏病毒（duck Tembusu virus, DTMUV）流行毒株分子遗传特征，经RT-PCR对全基因组序列分段扩增，并克隆、测序及拼接，获得DTMUV全基因组序列，命名为GXQZ01-DTMUV-2020株。结果显示，该毒株基因组全长为10 991 bp, 5′端UTR为94 bp, 3′端UTR为619 bp,含有1个开放阅读框（ORF）为10 278 bp,编码3
【基金项目】
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广西壮族自治区自然科学基金资助项目（2020GXNSFBA297066）；
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为了解广西壮族自治区鸭坦布苏病毒（duck Tembusu virus, DTMUV）流行毒株分子遗传特征，经RT-PCR对全基因组序列分段扩增，并克隆、测序及拼接，获得DTMUV全基因组序列，命名为GXQZ01-DTMUV-2020株。结果显示，该毒株基因组全长为10 991 bp, 5′端UTR为94 bp, 3′端UTR为619 bp,含有1个开放阅读框（ORF）为10 278 bp,编码3 425个氨基酸。相似性分析结果显示，GXQZ01-DTMUV-2020株与水禽源TMUV参考毒株的核苷酸相似性为85.7%～99.7%,氨基酸相似性为92.0%～100%;与NCBI上其他广西DTMUV流行株的核苷酸相似性为94.1%～98.5%,氨基酸相似性为97.7%～100%;与TMUV首个分离株MM＿1775核苷酸相似性为85.8%～91.6%,氨基酸相似性为92.0%～98.5%。基于ORF、E及NS1基因绘制遗传进化树显示，GXQZ01-DTMUV-2020株与广西DTMUV流行株GX2012、GX2013E同属于2.1亚群，而广西的GX2011、GX2015株同国内其他DTMUV流行株属于2.2亚群，表明广西DTMUV流行株呈现不同的遗传进化趋势。重组分析结果显示，CHN-YC、AH2014、HB2016、HD2-2013株存在重组现象，而广西DTMUV毒株未检测到重组信号。利用BEAST软件对ORF、E及NS1基因遗传进化速率评估结果为1.146×10-3,1.467×10-3,1.319×10-3替换/（位点·年）,表明E基因进化最快。本研究丰富了DTMUV基因库信息，同时为广西地区DTMUV分子流行病学研究与防控技术制定提供基础数据。
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