【摘 要】
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目的利用转录物组测序技术探寻差异表达长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)、mRNA与Hespintor抗肿瘤潜在机制的关联性。方法 首先建立人肝癌裸鼠移植瘤模型,分组给药4周后取瘤体,分别构建Hespintor治疗组、溶剂对照组瘤组织cDNA文库并进行转录物组测序,基于RNA-seq数据筛选差异表达lncRNA、mRNA基因集,继而进行功能富集及相互作用分析,
【机 构】
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莆田学院药学与医学技术学院医学微生态学福建省高校重点实验室
【基金项目】
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福建省自然科学基金项目(No.2021J011100); 2018年福建省高校新世纪优秀人才项目; 莆田市科技计划项目(No.2017S2001)~~;
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目的利用转录物组测序技术探寻差异表达长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)、mRNA与Hespintor抗肿瘤潜在机制的关联性。方法 首先建立人肝癌裸鼠移植瘤模型,分组给药4周后取瘤体,分别构建Hespintor治疗组、溶剂对照组瘤组织cDNA文库并进行转录物组测序,基于RNA-seq数据筛选差异表达lncRNA、mRNA基因集,继而进行功能富集及相互作用分析,再利用网络模块划分方法寻找Hespintor作用靶点基因并构建调控网络。结果 筛选获得Hespintor治疗组高可信度的差异表达基因集lncRNA(DEGs lncRNA)2 003个和mRNA(DEGs mRNA)1 038个,DEGs lncRNA调控靶mRNA主要富集于PIP3激活Akt信号、p53信号通路、FOXO介导的转录和细胞周期等功能,DEGs mRNA主要富集于趋化因子信号通路、细胞外基质受体相互作用、补体和凝血级联等功能,两者关联性侧重体现在细胞行为、转录调控和细胞周期等三方面。结论 PI3K/Akt信号通路可能在Hespintor抑制肿瘤效应中发挥主导作用,诱导细胞周期阻滞于G1/S期并引起细胞凋亡。
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