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【目的】利用SSR分子标记对新疆长绒棉种质资源材料进行基因组检测及遗传多样性分析。【方法】从39对SSR核心引物中筛选多态性好而且稳定的34对,对19个长绒棉材料基因组进行检测,用NTSYS-pc2.11e软件遗传多样性分析。【结果】34对引物共扩增出108个多态性条带,平均每个引物为3.17个。共检测出160个等位基因,变异的多态信息含量（PIC）在0.1~0.89。材料间的遗传相似系数在0.635~0.933,平均相似度为0.784。遗传相似系数阀值在0.69时,可把19个材料分为5个类群。大部分新疆