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高等医学院校本科生的创新能力和综合素质培养是医学教育的重要目标。自主性实验的开展对于提高本科生的创新能力和综合素质具有重要意义,但自主性实验的实施并非触手可及,从实验选题、实验设计到实验实施的各个教学环节均存在许多困难。文章总结了自主性实验实施过程中经常遇到的各种问题,并提出了针对相关问题的对策。