研究了毕赤酵母Pichia pastoris表达的重组人复合α干扰素(cIFN)时不同诱导甲醇浓度对cIFN分离纯化得率的影响,并分析了原因。在5 L罐中采用0.25、0.50和0.75%(W/V)三个甲醇浓度诱导时,在0.75%高甲醇浓度诱导下cIFN表达水平最高,达到2.06 g/L,是0.25%低甲醇浓度诱导的1.24倍,但是低甲醇浓度诱导下cIFN分离纯化得率却高于高甲醇诱导浓度下3.75倍。另外,低甲醇浓度下发酵上清液cIFN抗病毒活性为2.85×108 IU/mL,较高甲醇浓度提高了4.48倍。进一步采用SDS-PAGE和Native-PAGE免疫印迹分析不同条件下发酵液中cIFN存在状态,发现在高甲醇浓度下cIFN容易形成大量的聚合体,分别为共价聚合和非共价聚合,而cIFN单体含量较少,但是低甲醇浓度诱导下情况完全相反。最终在0.25%甲醇诱导下分离纯化1 L发酵上清液可得0.73 g单体cIFN,是0.75%甲醇诱导下的3.84倍。