目的 了解云南省疟疾流行、防治及防控能力状况,为云南省消除疟疾行动计划暨全球基金疟疾项目的实施和评估提供基线数据.方法 按照《云南省消除疟疾行动计划暨全球基金疟疾项目基线调查方法》进行,根据疟疾疫情采用分层随机不等比例抽样法确定调查点开展调查工作.结果 2009年共报告疟疾病例3 163例,疟疾发病率0.69/万,输入病例占70.22％,发病率超过1/万以上的县占15.50％,有本地感染病例的县占33.33％,有本地恶性疟感染的县占13.18％.疟疾病人实验室检测率85.68％,确诊率85.93％,病人规范治疗率85.72％,病例个案调查率63.29％；疟疾发病48 h内就诊比例为62.63％,病例24h内网络直报率为99.72％.人群疟疾抗体阳性率4.07％,阳性几何平均滴度倒数(GMRT)为38.90;居民和中小学生疟防知识知晓率分别为74.58％和85.17％；居民长效蚊帐拥有率和使用率分别为34.00％和29.62％；药浸蚊帐拥有率和使用率分别为61.16％和62.97％.能开展疟原虫镜检的医疗机构比例为58.78％,疟原虫镜检培训率为40.00％,疟防人员、临床医生、村医疟防知识培训率分别为45.34％、21.76％和42.88％.结论 云南省疟疾流行仍然严重,疟疾防治网络建立不完善,三类县疟防能力不足.