本研究采用活体解剖和生化分析方法，首先比较了长江野生中华绒螯蟹（简称河蟹）降海洄游过程中，在淡水区域与长江口低盐度海水中的肝胰腺指数（hepatosomatic index,HSI）和性腺指数（gonadosomatic index, GSI）的变化，进一步比较了两种群河蟹肝胰腺和肌肉中总脂含量及脂肪酸含量差异。结果表明：（1）淡水组雄蟹的HSI和雌蟹的GSI均显著高于对应的半咸水组（P< 0.05）；无论雌性个体还是雄性个体，淡水组肝胰腺中的总脂含量均显著高于半咸水组（P< 0.05），淡水组和半咸水组肌肉中的总脂含量无显著差异（P>0.05）；（2）就肝胰腺中的脂肪酸组成而言，淡水组雄蟹和雌蟹肝胰腺中的C20:1n9、C18:2n6和C18:3n3显著高于半咸水组，而前者的C18:1n7、C20:5n3和C22:5n3均低于半咸水组，因此淡水组肝胰腺中总n-3多不饱和脂肪酸（∑n-3PUFA）及∑n-3PUFA /总n-6多不饱和脂肪酸（∑n-6 PUFA）比值显著低于半咸水组，而∑n-6PUFA含量较高（P <0.05）；（3）就雄体肌肉的脂肪酸组成而言，淡水组雄蟹肌肉中的C17:0、C18:0、C20:1n9、C18:2n6、C18:3n3和C20:2n6百分含量显著高于半咸水组，而半咸水组的C16:1n7、C20:5n3和C22:5n3含量显著高于淡水组，故其∑n-3PUFA和∑n-3PUFA / ∑n-6 PUFA的比值较高（P<0.05）；淡水组雌蟹肌肉中除C17:1n7和C20:4n6显著高于半咸水组（P <0.05）外，两组雌体其余脂肪酸变化规律基本与雄体类似。综上，长江中野生河蟹成体由淡水区洄游至咸水区时，肝胰腺指数及其总脂含量均显著降低，咸水区野生亲本已经完成交配和产卵，其肝胰腺和肌肉中的总n-3长链多不饱和脂肪酸（∑n-3-LC-PUFA,≥C20:2n）百分含量显著升高。