猪和鸡戊型肝炎病毒基因重组分析

来源 :黑龙江畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Zeshawn
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鸡戊型肝炎病毒(avian Hepatitis E virus,a HEV)衣壳蛋白的抗血清可以与猪戊型肝炎病毒(swine Hepatitis E virus,s HEV)的衣壳蛋白发生交叉反应,提示上述两种病原之间存在某种相关性。为了研究s HEV和a HEV之间是否存在基因重组现象,试验应用生物信息学方法对s HEV和a HEV的重组进行了系统分析,共收集了具有代表性的61条s HEVs全基因组序列,11条a HEVs全基因组序列,应用RDP4.24和Sim Plot3.5.1生物学软件对重组事件进行了分析。结果表明:a HEV与s HEV之间没有发现明确的重组信号,但s HEV间存在两个重组信号,分别存在于DQ450072毒株的1 993~2 724位核苷酸碱基和4 745~5 754位核苷酸碱基区间内。说明a HEV与s HEV之间不存在重组现象。
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