【摘 要】
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蛋白质相互作用网络（Protein-ProteinInteraction，PPI）聚类结果的评价方法的研究是检测PPI网络功能模块聚类结果正确与否的关键。介绍并分析了4种有代表性的PPI网络聚类的评价方
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蛋白质相互作用网络（Protein-ProteinInteraction，PPI）聚类结果的评价方法的研究是检测PPI网络功能模块聚类结果正确与否的关键。介绍并分析了4种有代表性的PPI网络聚类的评价方法，即p-value、匹配统计量、基于准确率和查全率的综合评价以及基于层结构的hF-measure，在此基础上考虑了主错误划分类与该预测类的相似性，提出了新的罚分函数和新的Sf-measure评价方法。仿真结果表明了各评价方法的特点及Sf-measure评价方法的有效性及合理性。
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