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从两条单链的集群式供应链出发,在单链纵向合作的基础上,建立了基于两条单链跨链横向不合作和合作供应链设计模型.并通过遗传算法,运用MATLAB和LINGO软件编程进行算例分析.发现基于两单链的集群式供应链在横向和纵向两维最优设计中,与纵横向合作的物料分配比例密切相关,计算得出当纵向合作的物料分配比例为0.8时,能达到在基于横向合作下的集群式供应链设计的最小成本;同时运输变动成本,特别是长期合作的纵向单位运输变动成本对集群式供应链设计,以及跨链横向合作有着较大的影响,而固定运输成本则影响较小.