铁矿尾矿放线菌分离株的系统发育分析(摘要)

来源 :农业科学与技术(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:xjtcfx
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[目的]通过确定12株典型分离株的系统发育地位,初步探讨铁矿尾矿中放线菌生物多样性.[方法]12株典型放线菌来源:将新鲜斜面菌株接种于贝奈特液体培养基中,28℃、180 r/min摇床培养至对数生长中期.镜检验纯后4℃、10000 r/min离心5 min,收集菌体.采用酚一氯仿法提取基因组DNA,PCR扩增16S rDNA.所测序列采用Blast与GenBank中序列比较后,挑取相似性较大的菌株序列,采用MEGA4.1构建所测序列与相关种属的邻接法(Neighbor joining)系统发育树,并分析其系统发育地位.[结果]12株铁矿尾矿放线菌均属于链霉菌属(Streptomyces),其中菌株034005与红灰链霉菌(S.rubrogriseus)最近,序列相似性为99.2%;菌株035035与灰白链霉菌(S.griseoloalbus)最近,序列相似性为98.7%;菌株035015和035030与脆弱链霉菌(S.fragilis)最近,序列相似性分别为99.9%和99.6%;菌株035024 与昌帕瓦特链霉菌(S.champavatii)最近,序列相似性为99.7%;菌株035004 和035034 均与娄彻氏链霉菌(S.rochei)最近,序列相同;菌株032004、032008和032015均与弗氏链霉菌(S.fradiae)最近,序列相似性分别为99.9%、99.8%和99.8%;菌株033003与黄褐链霉菌(S.flavofuscus)最近,序列相似性为100.0%;菌株035033与浅玫瑰链霉菌(S.roseolus)最近,序列相似性为99.8%.[结论]铁矿尾矿中可培养放线菌类群以链霉菌为主,其中存在大量潜在的新种.
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