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本文叙述在小肽的分子结构中能产生紫外吸收的实际上只有肽键和氨基酸的侧链基团。当肽键在200－300nm波长范围内的吸收峰已经确定的条件下，分析不同氨基酸的侧链结构在200－300nm范围内的吸收情况，分析结果表明：在小肽的分子结构中，200－220nm处的吸收峰主要是由肽健产生的，270－290nm范围内的吸收主要是由芳香氨基酸侧链的大π键产生的，当洗脱液在200－220nm无吸收时，检测波长设在200nm-220nm比设在250nm-300nm更灵敏、更可靠。