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为了适应政府综合财务报告制度改革需要,财政部印发了《政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表》,自2019年1月1日起实施。但就现在高等院校的财务管理制度来说,并没有与之相配套的管理制度,会计核算基础范围扩大、财务信息系统、资产管理流程无法适应新的要求等一系列问题日益凸出。本文在分析新政府行政事业会计制度对高校内部财务审计模式转型影响的同时,积极主动地探索了高校内部财务审计转型的方法。