剩余价值学说与“历史科学”有着密切的关联，存在双重逻辑：马克思创建剩余价值学说的历程经历了研究内容、研究领域、研究方法、研究思路的多重转变，它既是灵活运用“历史科学”的表率，亦是作为政治经济学的理论基石而使之成为“一门历史的科学”的必然结果。从研究内容的演进逻辑来讲，马克思经历了从眷注“异化劳动”这一剩余价值的结果表现到探析剩余价值的产生之源，再到揭示资产阶级剩余价值必然灭亡的“不可避免”的命运的研究，形成了政治经济学的历史科学。从研究领域的演进逻辑来讲，马克思经历了从哲学审视到政治经济学批判，再到科学社会主义的发展旨归，形成了社会主义的历史科学。从研究方法的演进逻辑来讲，马克思创造了“从抽象到具体”的政治经济学方法革新，从揭示剩余价值一般规律到揭露“利润、利息、地租”剩余价值特殊表现形式的剥削本质，形成了唯物主义辩证法的方法论科学。从研究思路的演进逻辑来讲，马克思从历史经验逻辑、思想理论逻辑、主题实践逻辑的辩证统一高度创立了科学剩余价值理论，建构了科学社会主义理论体系，形成了唯物主义历史观的认识论科学。