根据2007-2008年崇阳溪7个采样站位鱼类资源的调查资料,分析了崇阳溪鱼类种类组成、优势种、生态类型以及鱼类多样性等特点。调查共采集鱼类73种,隶属5目、17科、65属;其中福建省保护动物鳗尾鱼央(Liobagrus anguillicauda)1种,福建省特有种闽江扁尾薄鳅(Leptobotia tientaiensis compressicauda Nichols)、纵纹原缨口鳅(Crossostoma stigmata)、裸腹原缨口鳅(Vanmaneniagymnetrus Chen)、花尾缨口鳅(Crossostomaf ascicauda Nkhols)和拟腹吸鳅(Pseudogastromyzon fasciatus)等5种。采用Pinkas的IRI指数进行分析,崇阳溪鱼类优势种有半刺厚唇鱼(Acrossocheilushemispinus)、圆吻鲴(Distoechodon tumirostris Peters)、宽鳍(Zacco platypus)、黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、大眼华鳊(Sinibrama macrops)等5种。崇阳溪鱼类生态类型以杂食性、中下层和适应急流生活的鱼类为主。鱼类多样性指数S7站位较高,群落结构较为稳定,这可能与其底质结构复杂、径流量较大有关。